中华人民共和国西双版纳海事局是中华人民共和国澜沧江海事局下设的直属局，前身为中华人民共和国西双版纳港务监督局（云南省交通厅西双版纳港务监督局）。1993年经国务院和云南省机构编制委员会批准设立，1995年9月筹建，1996年11月正式挂牌成立，是景洪港对外开放口岸检查检验机构。2003年9月，更名为中华人民共和国西双版纳海事局。2009年12月，经省委编办批准，加挂云南省澜沧江西双版纳航务管理处牌子，实行两块牌子、一套班子管理。属公益一类事业单位。

西双版纳海事局单位规格为正处级，内设行政办公室、安全监督科、航行保障科、船舶检验所、船员管理科、港航派出所、关累海事处7个科室。