行政办公室职责：

拟定管理局各项工作制度，并监督执行；负责管理局各种会议的组织工作；负责管理局综合性会议及其它重要文件、报告、讲话的起草工作；负责管理局文、电和印章的运行和管理；负责局领导的文秘工作；负责管理局财务管理、国有资产行政管理；负责管理局重大活动的组织与协调；负责管理局基建、人事、收发、信息、保密安全、消防、接待、车辆、办公用品以及后勤管理的日常工作；承办局领导交办的其它工作。

资源保护部职责：

贯彻执行国家、省、州有关自然保护的法律法规和方针政策；负责保护区资源管理计划的制定和实施，积极开展资源巡护与林政稽查，制止破坏自然资源的违法行为，保护自然环境和自然资源；负责做好森林防火工作的计划及实施；负责野生动物肇事的调查、统计、补偿工作；负责保护区内资源保护和森林防火设施的日常管理、维护工作，加强对各管理站及护林员的管理；完成局领导交办的其它工作。

科研监测部职责：

负责保护区科研项目的计划、可行性审核、上报审批；负责保护区科研项目的实施管理、成果评估和推广工作；负责保护区科技信息、资料的收集和管理；组织开展生物多样性保护的科研和监测工作，并负责各类监测工作的具体管理；负责保护区科技信息交流、科技扶贫、科普教育、科学实用技术推广及环境意识教育、宣传、培训等工作；加强对外的科技交流与合作，并负责对外科研合作项目的实施与管理；完成局领导交办的其它工作。

社区工作部职责：

掌握保护区内及周边社区村民土地利用、经济发展状况，按照国家的法律、法规、政策，结合社区实际，协调、处理好资源保护与社区经济发展的矛盾；制定社区发展规划，协调当地政府做好社区工作；多方争取资金，扶持社区经济发展，建立社区共管体系；协调有关科技部门，做好农业技术推广工作和能源建设；组织开展保护区的多种经营，结合保护区景观资源，与社区政府、相关部门和群众共同发展生态旅游事业；完成局领导交办的其它工作。